El proceso se organiza en torno a ocho territorios o barrios. Éstos son: La Alhóndiga, El Bercial, Centro-San Isidro, Getafe Norte, Juan de la Cierva, Las Margaritas, Perales del Río y Sector III-Cerro Buenavista.

En cada uno de ellos se constituye una Mesa de Barrio, integrada por vecinos y vecinas, tanto representantes de las asociaciones del barrio como personas a título individual, y encargada de organizar y dinamizar el proceso.

Así mismo, en cada barrio se celebrará una Asamblea de Barrio para  priorizar entre las propuestas presentadas que se ajusten a los requisitos, determinados en el documento de Normas de Funcionamiento del Presupuesto Participativo para el año 2008 .

Posteriormente, los Servicios Técnicos municipales procederán a estudiar las propuestas siguiendo el orden de prioridad obtenido en las asambleas, para determinar su viabilidad técnica, jurídica y económica. Tras confirmarse su viabilidad, se iniciará el proceso de diseño y ejecución de las propuestas. El proceso se repetirá respetando el orden de prioridad de las propuestas, hasta agotar el presupuesto disponible en cada barrio.

Por último, se llevará a cabo el Consejo del Presupuesto Participativo, donde se reúnen representantes de todos los barrios, técnicos municipales y responsables políticos para poner en común lo decidido en los barrios, ratificarlo, y evaluar el proceso seguido con el fin de mejorarlo.