Se crea como laboratorio municipal de alimentos en el año 1981. Se amplía la actividad analítica en el campo medioambiental en el año 1984. Ha servido como soporte analítico en el ámbito de aguas, alimentos y medio ambiente tanto para el municipio de Getafe como para el Área Sanitaria X de la Comunidad de Madrid.

Desde el año 2001 el Laboratorio Municipal está acreditado por la Empresa Nacional de Acreditación y Certificación (ENAC) con el número 265/LE534 para productos alimenticios y aguas, según la Norma UNE-EN ISO/IEC 17025:2005

La acreditación de un laboratorio demuestra la competencia técnica y garantiza la fiabilidad de los resultados. ENAC evalua al laboratorio periódicamente, realizando una extensa auditoría de la actividad del Laboratorio incidiendo en los factores que determinen resultados analíticos fiables.

Desde el año 2005 el Laboratorio está inscrito en el Registro de Laboratorios de la Comunidad de Madrid para la realización de controles analíticos de productos alimenticios, con nº de registro 28ABCD/M.